- يختص قسم الملاحة الداخلية بإصدار تراخيص المراكب الشراعية الغير آليه .

- وكذلك تراخيص القيادة لإفراد الطاقم العاملين على المراكب الشراعية الغير آليه .
- والمرور والتفتيش على المعديات التي تعمل في نطاق محافظة الاقصر وكذلك تحصيل الرسوم المستحقة على المعديات .